- المرحلة التمهيديّة، وفيها مجموعة من المواد المختصرة التي يدرسها الطالب ويختبر فيها قبل أن ينتقل إلى المستوى الأول.
- ‏المستوى الأول، ويتناول فيه موضوعات متعدّدة منها: تعزيز اليقين، وتثبيت ثوابت الإسلام، وتعزيز الهويّة والثقافة الإسلاميّة وتمييزها عن غيرها، وترتيب المعرفة الفكريّة عند الإنسان، وتاريخ الأفكار، والانطلاق في نقد الاتّجاهات الفكريّة المخالفة للإسلام.
- ‏المستوى الثاني: تُدرس فيه بعض موضوعات المستوى الأول بدرجة أعلى، مثل تعزيز اليقين ونقد الاتجاهات الفكرية ونظرية المعرفة، وتدرس فيه مواد جديدة، مثل: العقل الشرعي المفكر، والإصلاح الفكري، ومادة أخرى في نقد الشبهات.
- ‏المستوى الثالث: التوسُّع في المجالات لذات موضوعات المستويين الأول والثاني.

تخريج المتمكّنين في المجالات الفكريّة المتصلة بالهويّة الإسلاميّة وما يضادّها من إشكالات وانحرافات.

- طلاب العلم الشرعي.
- ‏المربّون ممّن لهم اتصال بالشباب، وخاصة من المرحلة الثانوية فما فوق.
- ‏من لهم اهتمام سابق بهذا المجال.

3 سنوات

- تُقسَّم مُقررات كلّ مرحلة على الأيام، وتُتابع من خلال اختبارات دوريّة، تتخللها البثوث المباشرة وبعض اللقاءات لطرح الأسئلة المتعلّقة بالبرنامج.
- يُضاف في المستوى الثاني والثالث بعض التكليفات والأوراق والبحوث والتلخيصات التي يقدّمها الطالب، للتأكُّد من مقدار الاستفادة.

- الأولى: وصول الطالب إلى درجة التمكُّن في العلم، فيكون على إدراك جيّد بأصول هذا المجال، ومركزيّاته، وأهمّ ما كُتب فيه.
- الثانية: وصول الطالب إلى درجة الرّقم الصعب الذي تجاوز مرحلة التمكّن الذاتيّ إلى مرحلة القدرة على التأثير المحكم بهذا العلم، مثل إلقاء المحاضرات وإجراء بعض البحوث، وهي درجة أقل من التخصص.